Исторический труд Агафия написан под сильным влиянием Прокопия Кесарийского, однако если Прокопий заботится, прежде всего, о строгости и достоверности деталей повествования, то Агафий большее внимание уделяет стилю и философским отступлениям.
Сочинение Агафия охватывающего период времени с 552 по 558 г., и содержит описания войн с готами, вандалами, франками и гуннами, а также персидских войн, и является ценным источником информации по истории, религии и этнографии современного ему периода.